Valkininkų stotis yra įsikūrusi Valkininkų miestelyje, kuris atsirado šios stoties dėka. Ši stotis buvo ne tik krovininė, bet ir tarpmiestinė, čia stodavo keleiviniai garvežiai pasipildyti vandens ir tęsti kelionė. Šiuo metu čia stoja Vilnius - Varėna traukinys.